1564年 米盖尔·洛佩斯·德·利雅实比率西班牙舰队（自墨西哥）出征菲律宾；1571年在马尼拉了建立殖民首府。16-18世纪，西班牙和中国之间的贸易往来密切。利雅实比向国王腓力二世说明通过马尼拉港和中国、日本通商的可能性。这种贸易延伸到墨西哥（阿卡普尔科）和西班牙（塞维利亚），由此开通了中国-菲律宾-墨西哥-西班牙多边贸易。来自中国的产品主要是线，丝绸和瓷器。1580年前后，有五千多华人居住在被称为马尼拉的Parián或是西班牙语区Luzón的唐人街。

      闻名遐迩的中国之船运载东方货物抵达阿卡普尔科，西班牙大帆船载满这些物品，每年两到四次从维拉克鲁斯起锚。巨大的船只经菲律宾马尼拉港横渡。从阿卡普尔科启程的船借助厄瓜多尔季风航行，在马尼安纳斯岛（islas Marianas）和关岛补给食物和水，继续航行至菲律宾群岛。1565年，西班牙神父，圣奥古斯丁教派信徒，宇宙志学者安德烈斯·厄达内塔发现了黑潮--太平洋黑潮（北太平洋的副热带环流， 日本暖流），这股浩瀚的海流为（菲律宾和墨西哥之间）的环行航路创造了得天独厚的有利条件。大帆船从马尼拉港出发，沿日本列岛循 黑潮东航。满载商品的船只需时4，5个月至7个月抵达加利福尼亚海岸，由此南下直抵阿卡普尔科港。从西班牙沉没在马尼拉的“圣迪耶哥”号帆船所载金银财宝的情形，可以说明中华大帝国和西班牙殖民帝国间贸易往来的重要性 : 即西班牙大帆船或中国之舟来往的马尼拉-阿卡普尔科-维拉克鲁斯-塞维利亚航线。这些财宝是中国明朝和阿斯图里亚斯王室统治下的西班牙进行贸易的重要佐证。大量重要物资飘洋过海：从阿卡普尔科运出来自西班牙殖民地的白银（银条或银元），染料用的胭脂虫红，种子，甘署，烟草，鹰嘴豆，巧克力和可可，西瓜，葡萄和无花果；从西班牙运来桶装的葡萄酒，橄榄油。从马尼拉运出的中国商品包括布匹和各种丝绸制品（长袜，围巾，床单或毯子），中东的波斯地毯；来自印度的棉织品；来自中国，交趾支那（Conchinchina）和日本的扇子，各类家具如箱子，首饰柜和上漆珠宝盒，梳子，铃铛，屏风，文具匣和瓷器。水手们从摩鹿加岛（Molucas），爪哇岛和斯里兰卡带来香料，主要是clavo de olor，桂皮。其他来自东方的商品还有驼毛，蜂蜡，象牙雕艺术品- 宗教人物，编筐用藤本植物，玉石，琥珀，宝石，木头和软木，珍珠母和贝母，铁，锡，铜铅，硫磺，火药，水果和蔬菜。这一时期，南中国海，印度尼西亚和太平洋被视为西班牙的“内湖”（或西班牙海）。自17世纪开始，荷兰人和英国人开始侵入。

      从开始，通过这条航线开展的贸易就具有重要意义，它同西班牙帝国的其他市场产生了不平衡。1593年1月11日，菲利浦二世在马德里敕许，禁止船队从秘鲁和新大陆前往中国和菲律宾，也不准许把这里的任何商品带到中国。在此令里，肯定了“中国在贸易中获利极大，而我国，我王室的买卖持续受到很多损失。

      西班牙和葡萄牙王室的联姻也把问题带到这条贸易线路上。为避免影响各王室的利益，禁止澳门和马尼拉之间的贸易往来。

      传统上，我王国和中国之间相互敬重，没有发生过战事。卡洛斯三世建立的菲律宾王室公司推动了18世纪的贸易发展。由于那一时期中菲贸易的增加，在广东开设了西班牙领事馆，给予王室公司直接支持。

      墨西哥独立战争使菲律宾和墨西哥之间的贸易于1813年完结。因为和其他大国，英国、法国和荷兰的贸易纷争，菲墨之间的贸易自17世纪末就开始下滑。此外，这些大国已不尊重托尔德西里亚斯条约(是西班牙和葡萄牙两国于1494年6月7日，在西班牙卡斯蒂利亚的托尔德西里亚斯签订的一份旨在瓜分新世界的协议) 。欧洲新崛起的国家不但把触角伸到亚洲而且也伸到了加勒比。这场新的贸易战给西班牙在美洲和菲律宾的买卖带来了负面影响。墨西哥独立后，自1815年起，中国和菲律宾、西班牙直接进行贸易往来。通过王室公司，菲律宾成为贸易中新主角。这种局面一直到1898年，菲律宾沦为美国殖民地而告终。西班牙和中国之间的贸易从此衰落下来。从18世纪开始，两国关系日渐疏远。西班牙经由菲律宾继续和中国进行贸易，但是鉴于西班牙帝国式微以及国际上新崛起国家的影响，中西两国的官方的来往极其有限。